Taqman qPCR Mix 2X (即用型探針法熒光定量mix)
產(chǎn)品名稱: Taqman qPCR Mix 2X
中文別名: 即用型探針法熒光定量mix
產(chǎn)品編碼: T021-5ml
2X 探針法qPCR Mix (TaqMan熒光定量PCR試劑盒)是基于熒光探針檢測的即用型 PCR 試劑盒,可以對靶片段進(jìn)行實(shí)時(shí)定量 PCR 分析(quantitative PCR、qPCR)。
產(chǎn)品含有經(jīng)過優(yōu)化的緩沖液組分、熱啟動 Taq DNA 聚合酶、Taq DNA 穩(wěn)定劑、dNTPs、MgCl2和穩(wěn)定劑等所有實(shí)時(shí)定量 PCR 所需要的成分
熒光定量PCR(qPCR)是大家常用的分子生物學(xué)技術(shù),根據(jù)實(shí)驗(yàn)方法的不同
qPCR可以分為染料法(SYBR Green法為代表)和探針法(Taqman法為代表)
因?yàn)椴僮骱唵危瑑r(jià)格便宜,SYBR Green法qPCR 受到了更為普遍的使用。
但是SYBR Green法并非萬能的,在很多時(shí)候SYBR Green無法滿足實(shí)驗(yàn)的需要
Taqman qPCR特異性強(qiáng),信噪比高,能夠適用于多重qPCR,數(shù)據(jù)更具說服力
Taqman法qPCR的原理:
Taqman是一段短的單鏈DNA探針,能夠和模板DNA進(jìn)行退火。Taqman探針的5’端帶有一個(gè)報(bào)告基團(tuán)(R),3’端帶有一個(gè)猝滅基團(tuán)(Q)。報(bào)告基團(tuán)所發(fā)出的熒光會被猝滅基團(tuán)所吸收,因此正常情況下熒光探針是不會發(fā)出熒光的。在PCR的延伸過程中,DNA聚合酶沿著模板鏈從5’到3’的方向合成新鏈,當(dāng)DNA聚合酶到達(dá)Taqman探針結(jié)合位點(diǎn)時(shí),DNA聚合酶的5’-3’外切酶活性會將Taqman探針進(jìn)行水解,導(dǎo)致Taqman探針的報(bào)告基團(tuán)脫離了猝滅基團(tuán),從而發(fā)出熒光??梢愿鶕?jù)熒光值的高低,判斷PCR過程中目的片段產(chǎn)生的多少,從而實(shí)現(xiàn)對目的基因進(jìn)行實(shí)時(shí)定量。
在Taqman qPCR中,上下游引物只有擴(kuò)增探針?biāo)Y(jié)合的片段時(shí),才會產(chǎn)生熒光,非特異擴(kuò)增是不會產(chǎn)生熒光的,因此Taqman qPCR的特異性非常好。另外,可以用不同的報(bào)告基團(tuán),標(biāo)記多個(gè)熒光探針,實(shí)現(xiàn)在一管PCR體系中,同時(shí)對多個(gè)基因進(jìn)行定量,這樣不僅實(shí)驗(yàn)的通量大大提高,而且實(shí)驗(yàn)的一致性也更好。
什么時(shí)候需要使用探針法qPCR:
相對于SYBR Green qPCR,探針法qPCR需要設(shè)計(jì)和合成特異的熒光探針,增加了設(shè)計(jì)難度和實(shí)驗(yàn)成本。但是,當(dāng)你遇到如下情況時(shí),Taqman qPCR是你的第一選擇。
>>>1.基因檢測
以Taqman為代表的探針法qPCR最常用的應(yīng)用場景就是基因檢測,包括醫(yī)療診斷,環(huán)境微生物檢測,轉(zhuǎn)基因檢測等。這些應(yīng)用場景對結(jié)果的特異性要求非常高,而染料法qPCR的結(jié)果很容易受到非特異性擴(kuò)增的干擾,因此一般都是使用Taqman qPCR進(jìn)行檢測。
>>>>2.很難設(shè)計(jì)特異性引物
qPCR對引物的擴(kuò)增效率要求很高,如果用相對定量法(Livak法)進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,需要保證引物的擴(kuò)增效率在90%到105%之間,否則最后得到的數(shù)據(jù)不真實(shí)。然而有時(shí)候,為了保證擴(kuò)增的特異性,只能在某個(gè)特異位點(diǎn)設(shè)計(jì)引物,從而犧牲了一些其它的引物設(shè)計(jì)原則,比如GC含量過高,引物有二級結(jié)構(gòu)等,導(dǎo)致qPCR擴(kuò)增的效率過低。這種情況下用Taqman qPCR可以很好的解決這一點(diǎn),因?yàn)門aqman 探針本身就可以保證特異性,因此設(shè)計(jì)引物的時(shí)候有更多靈活性,更容易設(shè)計(jì)擴(kuò)增效率高的引物對。
>>>>3.發(fā)表高水平文章
由于Taqman法比SYBR Green法具有更好的特異性,實(shí)驗(yàn)結(jié)果更接近真實(shí),所以很多高水平文章更青睞于Taqman qPCR的結(jié)果。特別是一些關(guān)鍵基因的關(guān)鍵結(jié)果,如果有Taqman qPCR的數(shù)據(jù),會給你的文章加分不少。
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