99%包裝規(guī)格:10ml(1ml*10) 100ml(100*1ml)" />
dNTP 2.5mM(脫氧核苷三磷酸)
產(chǎn)品名稱:dNTP 2.5mM 【HPLC ≥99%】
中文別名: 脫氧核苷三磷酸
產(chǎn)品編碼:D006-10ml(1ml*10)
dNTP混合物是dATP、dGTP、dCTP和dTTP的等摩爾混合物。以溶液鈉鹽形式提供,pH 7.0。可以作為耐熱DNA聚合酶的底物使用。
進(jìn)行PCR擴(kuò)增時(shí), dNTP混合物(2.5 mM)標(biāo)準(zhǔn)用量是4 μl/50 μl反應(yīng)體系。
本品2.5mM混合溶液中有四種核苷酸(dATP,dCTP,dGTP,dTTP),每一個(gè)的濃度都為2.5mM。
DNTP 四種核苷酸,A、U、G、C.混合物,主要作用在于PCR在第三步延伸的過程中,需要這幾種核苷酸,以堿基互補(bǔ)原則,在酶的作用下與你需要擴(kuò)增的模板鏈進(jìn)行連接,
從而達(dá)到復(fù)制模板鏈的目的.
產(chǎn)品特點(diǎn):
純度大于99 %
無DNase和RNase污染
無人類和E.coli DNA污染
避免頻繁的凍融,使用之前混勻。
PCR 反應(yīng) 概要:
1.配置反應(yīng)體系
將各成分依次加入到 0.5ml 的離心管中
擴(kuò)增使用熱啟動(dòng)酶,可在常溫下操作,非熱啟動(dòng)型的酶要在低溫配置反應(yīng)體系。
2.按照試劑盒說明書設(shè)置反應(yīng)時(shí)間和溫度,擴(kuò)增結(jié)束后電泳鑒定
3.瓊脂糖核酸電泳:
· 將電泳所用器具蒸餾水洗凈,架好梳子
· 根據(jù)要分離的 DNA 片段大小制備合適濃度的瓊脂糖凝膠,準(zhǔn)確稱取一定的瓊脂糖加入到錐形瓶中,加入 30ml 左右的電泳緩沖液(TAE 或 TBE)
· 在微波爐中加熱融化后冷卻至 40℃左右,充分混勻后倒入電泳槽中
· 室溫下凝固 40 分鐘左右,小心拔出梳子,將凝膠放置電泳槽中準(zhǔn)備點(diǎn)樣
· 在電泳槽中加入電泳緩沖液,漫過凝膠表面即可,點(diǎn)樣孔內(nèi)不要有氣泡
· 樣品點(diǎn)樣前準(zhǔn)備好,(在八連管中)加入 5ul 樣品,1ul 的 6xLoding buffer 和 1ul 的染料混合,用搶將混合后的樣品緩緩注入到點(diǎn)樣孔中,注意不要串孔
· 按照正負(fù)極(紅正黑負(fù)),接通電源,電壓 40-60V,時(shí)間 30-40min,可根據(jù)溴酚藍(lán)的位置判斷是否終止電泳
· 電泳結(jié)束,關(guān)閉電源,凝膠成像觀察,并對(duì)比 marker 確定片段大小
(不同的瓊脂糖濃度分離不同大小的 DNA 片段)
引物
引物是決定 PCR 反應(yīng)成敗的關(guān)鍵,要保證擴(kuò)增的準(zhǔn)確、高效,引物的設(shè)計(jì)要遵循如下原則:
1. 引物的設(shè)計(jì)在 cDNA 的保守區(qū)域,在 NCBI 上搜索不同物種的同一基因,通過序列分析的軟件,得到不同基因相同的序列就是該基因的保守區(qū)
2. 引物的長(zhǎng)度:15-28bp,長(zhǎng)度大于 38bp,會(huì)使退火溫度升高,不利于普通 Taq 酶的擴(kuò)增
3. 引物 GC 含量在 40%-60%,Tm 值最好接近 72℃
4. 因密碼子的簡(jiǎn)并性,引物的 3’端最好避開密碼子的第三位(最好為 T)
5. 堿基分布錯(cuò)落有致,3’端不超過 3 個(gè)連續(xù) G 或 C
6. 引物自身不要形成發(fā)夾結(jié)構(gòu),引物設(shè)計(jì)完成,要 BLAST 驗(yàn)證
模板
PCR 擴(kuò)增對(duì)模板的要求不高,單鏈、雙鏈 DNA 均可作為擴(kuò)增片段,雖然 PCR 能夠擴(kuò)增微量的 DNA,為了保證擴(kuò)增的特異性,對(duì)不同來源的模板,起始濃度有一定要求,可以是純化后的樣品也可以是粗制品,不同來源的模板采取不同的處理方法,實(shí)驗(yàn)?zāi)0宓募兓胶?jiǎn)單越好,但模板中如果含有任何的 Taq 酶抑制劑、蛋白酶、核酸酶等,會(huì)干擾反應(yīng)。模板提取注意保存,不能放置太久,避免反復(fù)凍融并防止降解。多數(shù)人會(huì)忽略這一問題,當(dāng)實(shí)驗(yàn)結(jié)果沒有任何條帶時(shí),可優(yōu)先考慮是否為模板降解的原因。
其他
1. Taq DNA 聚合酶:Taq 酶種類有很多,熱啟動(dòng)酶,高保真酶,根據(jù)各自實(shí)驗(yàn)的應(yīng)用選擇合適的酶擴(kuò)增,一般的反應(yīng),化學(xué)修飾的熱啟動(dòng)酶即能很好的完成,化學(xué)修飾熱啟動(dòng)酶能夠 避免低溫下任何非特異性產(chǎn)物產(chǎn)生。酶的濃度對(duì)擴(kuò)增有一定影響,酶用量過多,會(huì)導(dǎo)致非特異性產(chǎn)物,操作按照說明書即可。
2. dNTP:四種 dNTP 的濃度要相同,其中任何一種濃度偏高或偏低,都會(huì)引發(fā)堿基的錯(cuò)誤滲入。此外,dNTP能夠和體系中鎂離子結(jié)合,從而影響體系中鎂離子的濃度。
3. 緩沖液:緩沖液一般隨酶提供,一般的 PCR 試劑盒包括 Taq 酶,緩沖液,dNTP,水。初次擴(kuò)增,可以完全按照試劑盒的說明書操作,如果擴(kuò)增結(jié)果有問題,可自己嘗試摸索實(shí)驗(yàn) 條件或重新設(shè)計(jì)引物提取模板擴(kuò)增。
4. 因空氣中和手上有一定污染源,操作過程中要戴手套,在干凈的環(huán)境中配置反應(yīng)體系,防止空氣中的污染源。
5. PCR 擴(kuò)增的水要經(jīng)過高壓滅菌或 0.2um 濾膜過濾。
6. 產(chǎn)物切膠回收二次擴(kuò)增前,要先鑒定,二次擴(kuò)增模板稀釋 1000 倍。
常用于PCR、real-time PCR、RT-PCR、cDNA合成、引物延伸反應(yīng)、DNA測(cè)序、DNA標(biāo)記等各種常規(guī)分子生物學(xué)反應(yīng)。
應(yīng)用:
• qPCR、RT-qPCR
• PCR、RT-PCR、cDNA 合成
• 高保真度和長(zhǎng)范圍 PCR
• 等溫?cái)U(kuò)增
• DNA 標(biāo)記
• 克隆
• Sanger 和下一代測(cè)序 (NGS)
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